Biệt Đội G.I Joe năm 2013 này tiếp nối nội dung ly kỳ, gay cấn của bộ phim hành động bom tấn năm 2009 Biệt Đội G.I.Joe 1.
Nội dung phim "đóng khung" tội ác chống lại đất nước, đội G.I.Joe phải bị xóa sổ theo lệnh của Tổng thống. Tất cả đã bị gài bẫy và chết gần như hết. Các thành viên trong nhóm còn sống sót phải đối mặt với Zartan, các kẻ thù, và các nhà lãnh đạo trên thế giới, hơn hết ... họ phải báo thù cho các chiến hữu của họ đã hy sinh. Mở màn cho cuộc chiến gây cấn với nhiều tình tiết hấp dẫn.